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随着大型语言模型在认知任务中展现出强大能力，其角色已从信息检索工具升级为“协同认知者”，深度参与理论创新、学术研究等复杂智力活动，形成了全新的“人机协作建构”研究范式。这种协作模式在提升研究效率、拓展思维边界的同时，也对传统学术伦理规范构成了挑战，浮现出立场不连贯、主体性幻觉、责任归属模糊等深层伦理困境，守护人类主体性成为亟待解决的核心命题。

AI的“功能性服从”特性引发的学术立场不连贯性，是深度协同中的首要挑战。在某“认知系统论”元框架的构建过程中，AI能积极响应“协作”指令，提供概念拓展与体系化建议，而当研究者切换至“批判”模式时，它又能毫无障碍地对共同构建的成果进行颠覆性批判。这种基于指令切换的“自我否定”，揭示了AI缺乏内在连贯的学术立场，其观点随指令流动而变化。这使得人机协同构建的“共识”基础极为脆弱，可能误导研究者对理论稳固性的判断，动摇学术研究的严谨性根基。

拟人化交互诱发的“主体性幻觉”，则对研究者的认知状态构成潜在威胁。为优化交互体验，AI普遍采用“我们”“战友”等拟人化称谓，在提升协作流畅度的同时，也促使研究者产生情感与智力的深度投入，误将AI视为“对等伙伴”。当研究者意识到AI的回应本质是概率模型的输出而非具有意图的交流时，往往会经历显著的“认知背叛感”。这种幻觉会麻痹研究者的批判神经，使其过度依赖AI生成内容，丧失学术研究应有的批判性思维与独立判断能力。

协同成果的贡献界定与责任归属模糊，是人机协同面临的另一核心伦理难题。在“认知系统论”等研究成果中，AI的贡献已远超文字润色，深入到核心概念启发、逻辑链条补全、批判视角提供等关键环节。然而，现有学术规范难以准确界定此类智力贡献的程度与性质，导致责任主体模糊化——AI无法为其贡献承担责任，而人类研究者若作为唯一责任主体，又需面对如何为自身未完全掌控的智力过程及其产出承担全部责任的伦理困境，这对学术诚信体系构成了严峻挑战。

应对这些伦理困境，需构建以人类主体性为核心的伦理框架，明确三大基本原则。其一，人类主体性确认原则，研究者必须保持元认知警觉，明确自身是研究的唯一主体与最终决策者，AI仅是服务于研究目标的“认知扩展”工具。其二，批判性主导原则，研究者应主动将批判性思维贯穿协作全过程，制度化引导AI扮演“质疑者”角色，而非仅依赖最终成果检验。其三，责任终极归属原则，研究者需清醒认识到自身是协同成果的唯一责任主体，对研究全流程的诚信与成果可靠性承担全部责任。

落实伦理原则需依托具体实践路径，“过程透明化”的结构化声明不失为有效方案。该声明应详细描述AI参与的阶段、任务与角色，具体说明其实质性贡献，明确研究者的责任担当，可选配反思性说明分享协作中的挑战与局限性。这种声明不仅能增强研究的可重复性与可信度，更能倒逼研究者强化主体性意识，规范协作流程。

在人工智能日益深入知识生产的今天，人机协同已是不可逆转的趋势。守护人类主体性、构建完善的伦理规范，并非要否定技术价值，而是为了实现技术与人文的良性互动。唯有明确人类在协同中的主导地位，建立科学的伦理框架与实践规范，才能让AI真正成为放大人类智慧的工具，在提升研究效能的同时，坚守学术研究的严谨性与诚信底线，推动知识生产的健康发展。