科研入门第一步!从看文献做起
但是文献中的结果图五花八门,看不懂怎么办?
喵学姐今天就给大家整理了6种常见的结果图解读,一起来看看吧
一、GO弦图
①内圈连线表示基因和生物过程之间的关联,相同颜色的连线表示这几种基因富集到该term上
②筛选出参与这些个生物过程的基因
③标注显著富集的GO term的名称和颜色标识
④不同颜色代表不同的GO term
二、KM生存曲线
①x轴:显示的是时间,单位是天,从0到1000。
②y轴:显示的是生存率的百分比,从0%到100%。
③P值:p小于0.05说明两组间差异具有统计学意义
④分组:颜色代表不同分组
⑤对应的曲线代表两条曲线在对应时间点的存活人数
⑥竖线:删失的数据,在研究结束前,部分个体尚未发生目标事件,或者因失访等原因无法再继续追踪。这些个体的确切生存时间未知,但知道他们至少在最后一次观察时间点时还未发生事件
三、UMAP图
①②横纵坐标:代表降维后的方向,是数据在二维空间坐标系中的新坐标轴,为了表示数据结构在降维后的相对位置
③每个点代表一个单细胞的数据,点的距离表示他们表达上的相似程度,距离越近越相似可以归类为同一类型
④相似类型细胞在途中聚集成簇,可以清楚看到不同细胞类型之间分布 颜色:不同颜色代表不同细胞类型
四、UPSET图
1.下方的点阵图中
①点阵图展示了疾病的交集情况,每行与左边柱形图的疾病对应,每列的圆点代表这些疾病交集(集合中的数量与上方的柱形图数量对应)
2.上方的柱状图
②纵坐标 代表交集中同时患这些疾病的人数
③每个柱子代表不同疾病交集的人数(与下方的点阵图对应)
3.左边的柱状图
④横轴代表单独每种疾病组中的人数(比如所有抑郁症患者的总数,无论他们是否还有其他疾病)
⑤纵轴对应点阵图中的每一行(即每一个单一的疾病)
五、相关性热图
①相关性系数,-1到1,绝对值越大相关性越强,红色表示正相关,蓝色表示负相关。
②热图部分的横纵坐标对应两两变量之间的相关性。
③线条表示变量与对应的数据矩阵存在相关性,线条的粗细代表相关性强弱
④对应线条的颜色,代表显著性水平
⑤方块大小和颜色表示相关性大小,方块越大颜色越深表示相关性越强
六、箱线图
①纵坐标表示分组
②箱体上沿为第三四分位数,表示75%的数据小于这个值
③中间的横线为中位数,表示数据的中间值
④箱体下沿为第一四分位数,表示25%的数据小于这个值
⑤竖线上下范围理论上为正态分布的99.3%置信区间,上端为数据最大值,下端为数据最小值
⑥点表示数据中的异常值